Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Usp49Q6P9L4 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Usp49Q6P9L4 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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Usp49Q6P9L4 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Usp49Q6P9L4 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Usp49Q6P9L4 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Usp49Q6P9L4 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Usp49Q6P9L4 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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Usp49Q6P9L4 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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Usp49Q6P9L4 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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