Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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