Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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Ttc39dQ0VF76 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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Ttc39dQ0VF76 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ttc39dQ0VF76 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ttc39dQ0VF76 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ttc39dQ0VF76 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ttc39dQ0VF76 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Ttc39dQ0VF76 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Ttc39dQ0VF76 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc39dQ0VF76 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms