Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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