Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BckdhaP50136 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
BckdhaP50136 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
BckdhaP50136 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
BckdhaP50136 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
BckdhaP50136 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BckdhaP50136 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.3 ms