Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms