Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms