Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms