Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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