Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hdac6Q9Z2V5 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hdac6Q9Z2V5 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hdac6Q9Z2V5 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hdac6Q9Z2V5 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hdac6Q9Z2V5 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Hdac6Q9Z2V5 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Hdac6Q9Z2V5 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Hdac6Q9Z2V5 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Hdac6Q9Z2V5 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Hdac6Q9Z2V5 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Hdac6Q9Z2V5 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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