Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Col5a3Q9JLI2 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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