Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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