Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms