Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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NischQ80TM9 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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NischQ80TM9 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
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NischQ80TM9 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
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NischQ80TM9 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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NischQ80TM9 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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NischQ80TM9 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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NischQ80TM9 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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NischQ80TM9 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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NischQ80TM9 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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NischQ80TM9 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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NischQ80TM9 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NischQ80TM9 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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