Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp49Q6P9L4 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms