Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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