Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms