Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms