Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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