Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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