Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Itga4Q00651 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms