Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms