Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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