Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxa2P31245 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxa2P31245 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms