Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms