Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.5 ms