Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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