Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm15028-201ENSMUST00000120295 370 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Lhx8O35652 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms