Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms