Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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PtprtQ99M80 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprtQ99M80 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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PtprtQ99M80 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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PtprtQ99M80 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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PtprtQ99M80 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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PtprtQ99M80 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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