Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Usp27Q8CEG8 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Usp27Q8CEG8 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Usp27Q8CEG8 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Usp27Q8CEG8 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Usp27Q8CEG8 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Usp27Q8CEG8 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Usp27Q8CEG8 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Usp27Q8CEG8 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Usp27Q8CEG8 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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