Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Atg4aQ8C9S8 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Atg4aQ8C9S8 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Atg4aQ8C9S8 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Atg4aQ8C9S8 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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