Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc29Q80VM3 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms