Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms