Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms