Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms