Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rpusd3Q14AI6 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rpusd3Q14AI6 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rpusd3Q14AI6 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Rpusd3Q14AI6 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rpusd3Q14AI6 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
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