Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Irx1P81068 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms