Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms