Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms