Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms