Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
P10404 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
P10404 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
P10404 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
P10404 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
P10404 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
P10404 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
P10404 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
P10404 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
P10404 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
P10404 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms