Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms