Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms