Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms