Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms