Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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RpainQ9CWY9 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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