Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Atg4aQ8C9S8 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Atg4aQ8C9S8 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Atg4aQ8C9S8 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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