Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Ccdc88cQ6VGS5 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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