Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms